Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms