Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efcab2Q9CQ46 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Efcab2Q9CQ46 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcab2Q9CQ46 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcab2Q9CQ46 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcab2Q9CQ46 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcab2Q9CQ46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efcab2Q9CQ46 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms