Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atg3Q9CPX6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg3Q9CPX6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms