Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt88Q9CPR6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt88Q9CPR6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms