Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf8Q99PV0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf8Q99PV0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms