Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim12aQ99PQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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