Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scd3Q99PL7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms