Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg3Q99P81 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg3Q99P81 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg3Q99P81 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg3Q99P81 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg3Q99P81 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcg3Q99P81 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcg3Q99P81 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcg3Q99P81 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcg3Q99P81 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg3Q99P81 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg3Q99P81 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcg3Q99P81 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms