Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird2Q99NI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird2Q99NI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird2Q99NI3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms