Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll1Q99NC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms