Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubqln4Q99NB8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms