Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac9Q99N13 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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