Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf17Q99MV7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms