Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds2Q99L43 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds2Q99L43 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds2Q99L43 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms