Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ciao1Q99KN2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms