Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ufsp2Q99K23 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufsp2Q99K23 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms