Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1bQ99JY6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1bQ99JY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms