Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip2Q99JG7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnip2Q99JG7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms