Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin3Q99JB8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms