Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms