Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan1Q99J59 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan1Q99J59 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms