Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SptssbQ925E8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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