Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csmd1Q923L3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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