Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrif1Q923B3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms