Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim59Q922Y2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms