Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms