Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb6Q922F4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms