Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpe65Q91ZQ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms