Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y44

Brdt, Bromodomain testis-specific protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrdtQ91Y44 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrdtQ91Y44 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrdtQ91Y44 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms