Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Basp1Q91XV3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Basp1Q91XV3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms