Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubtd1Q91WB7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubtd1Q91WB7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms