Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc3Q91W40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klc3Q91W40 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc3Q91W40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc3Q91W40 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc3Q91W40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc3Q91W40 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc3Q91W40 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms