Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp3Q91W36 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp3Q91W36 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms