Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHK8

Tmprss11d, Transmembrane protease serine 11D, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11dQ8VHK8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmprss11dQ8VHK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms