Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc115Q8VE99 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms