Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul7Q8VE73 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cul7Q8VE73 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms