Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1aQ8VDS4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1aQ8VDS4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms