Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ9

Kri1, Protein KRI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kri1Q8VDQ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kri1Q8VDQ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kri1Q8VDQ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms