Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ParnQ8VDG3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ParnQ8VDG3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms