Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt25Q8VCW2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms