Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms