Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms