Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4R4

Pitpnc1, Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnc1Q8K4R4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitpnc1Q8K4R4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitpnc1Q8K4R4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitpnc1Q8K4R4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitpnc1Q8K4R4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitpnc1Q8K4R4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitpnc1Q8K4R4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms