Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccm2Q8K2Y9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccm2Q8K2Y9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms