Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm48Q8K2X2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm48Q8K2X2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms