Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hacd3Q8K2C9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms