Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkd3Q8K1Y2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms