Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx5Q8K1E0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms