Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms