Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klre1Q8CJC7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klre1Q8CJC7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms